More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0419 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  61.47 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  57.83 
 
 
240 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  60.43 
 
 
246 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  59.91 
 
 
248 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  52.17 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  50.64 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.58 
 
 
237 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.62 
 
 
233 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.84 
 
 
236 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.48 
 
 
234 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.03 
 
 
236 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.41 
 
 
233 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.41 
 
 
233 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.75 
 
 
233 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.66 
 
 
234 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  47.16 
 
 
234 aa  204  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.41 
 
 
233 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 
234 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.61 
 
 
248 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 
231 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.38 
 
 
239 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.38 
 
 
237 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.38 
 
 
237 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.83 
 
 
231 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.83 
 
 
231 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
232 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.67 
 
 
244 aa  198  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.22 
 
 
241 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.02 
 
 
248 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.54 
 
 
248 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  46.84 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.07 
 
 
238 aa  197  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  42.61 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  51.52 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  43.7 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.71 
 
 
234 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  44.4 
 
 
240 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.88 
 
 
246 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
241 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  47.62 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  46.75 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  44.87 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4058  ABC transporter related  44.21 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  43.28 
 
 
239 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.96 
 
 
239 aa  195  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 
233 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  47.68 
 
 
251 aa  194  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  41.99 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
259 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
238 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4206  ABC transporter related  43.35 
 
 
240 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  44.87 
 
 
236 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
233 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
233 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
233 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  44.4 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
233 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
233 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
233 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  47.84 
 
 
234 aa  193  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  43.78 
 
 
240 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  43.29 
 
 
231 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  42.55 
 
 
237 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1984  ABC transporter related  44.35 
 
 
249 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
235 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  42.86 
 
 
231 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  44.93 
 
 
243 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.44 
 
 
235 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.69 
 
 
234 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  41.13 
 
 
231 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.61 
 
 
234 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  47.46 
 
 
244 aa  192  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
236 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7684  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
240 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.49 
 
 
235 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  42.13 
 
 
235 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  42.86 
 
 
231 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.42 
 
 
259 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.31 
 
 
238 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.42 
 
 
259 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.49 
 
 
234 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  191  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
234 aa  191  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  42.86 
 
 
231 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 
231 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
232 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>