More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0403 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.74 
 
 
231 aa  390  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1033  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.74 
 
 
232 aa  390  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.74 
 
 
232 aa  390  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.65 
 
 
231 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  76.62 
 
 
231 aa  371  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  61.3 
 
 
231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  59.23 
 
 
236 aa  264  8e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  55.79 
 
 
239 aa  258  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.79 
 
 
239 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.94 
 
 
237 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  53.85 
 
 
244 aa  251  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.08 
 
 
234 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
236 aa  248  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.85 
 
 
234 aa  248  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  50.86 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  53.48 
 
 
232 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.71 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  51.07 
 
 
236 aa  241  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 
233 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  51.07 
 
 
237 aa  241  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  51.07 
 
 
237 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
235 aa  240  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.36 
 
 
236 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.21 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.29 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50.43 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  49.79 
 
 
242 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  49.14 
 
 
233 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
233 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  46.55 
 
 
233 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.28 
 
 
235 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
233 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  47.44 
 
 
238 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  50.22 
 
 
240 aa  235  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  48.31 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 
238 aa  234  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.07 
 
 
238 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.15 
 
 
238 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.5 
 
 
242 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  48.5 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  48.07 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.46 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.5 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.07 
 
 
239 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.5 
 
 
251 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
237 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.58 
 
 
238 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 
242 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
233 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  231  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  47.46 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
233 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
233 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.43 
 
 
233 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  48.93 
 
 
236 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  46.22 
 
 
248 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  48.09 
 
 
252 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  48.07 
 
 
234 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.64 
 
 
233 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  48.29 
 
 
234 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  45.92 
 
 
238 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.85 
 
 
260 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>