More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0529 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  55.17 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.16 
 
 		 239 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.16 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.29 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  52.16 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.13 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  49.14 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 231 aa  234  9e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  53.25 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  48.71 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  48.71 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  49.17 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.14 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.07 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  49.34 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.71 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  49.14 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  50.21 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  49.14 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  46.67 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  46.67 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1033  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  51.3 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  46.67 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 231 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.25 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  48.1 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  49.57 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.1 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  47.35 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  47.08 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.78 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.41 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  47.64 
 
 		 256 aa  223  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  50.88 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.94 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.41 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  51.52 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.94 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  51.52 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  47.84 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  47.84 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  50.86 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  47.41 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.14 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  49.35 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>