More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1158 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1033  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
232 aa  460  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.13 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  87.83 
 
 
231 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.74 
 
 
231 aa  390  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  78.26 
 
 
231 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  61.3 
 
 
231 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  56.84 
 
 
236 aa  252  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  55.56 
 
 
239 aa  251  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  54.7 
 
 
244 aa  251  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.56 
 
 
239 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  53.88 
 
 
233 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.08 
 
 
234 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  53.02 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  53.02 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  51.49 
 
 
251 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.59 
 
 
233 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.79 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.22 
 
 
237 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  50 
 
 
233 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
237 aa  238  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
233 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 
235 aa  235  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.93 
 
 
236 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50.64 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  49.14 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  232  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.36 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  52.16 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  51.49 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.07 
 
 
235 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.28 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
247 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  52.61 
 
 
232 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  46.98 
 
 
233 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
236 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  49.14 
 
 
236 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  51.72 
 
 
233 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.64 
 
 
236 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 
241 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  51.71 
 
 
260 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  49.36 
 
 
253 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
245 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
234 aa  228  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  49.15 
 
 
238 aa  227  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
234 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.49 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.69 
 
 
244 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
233 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
234 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  48.07 
 
 
238 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
233 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  50.88 
 
 
240 aa  226  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 
236 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.07 
 
 
239 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  46.35 
 
 
238 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.79 
 
 
234 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
233 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.35 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  47.84 
 
 
233 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.5 
 
 
239 aa  224  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  47.86 
 
 
252 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.93 
 
 
235 aa  223  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  45.06 
 
 
238 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50.21 
 
 
240 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
234 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
235 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  45.69 
 
 
243 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  48.54 
 
 
247 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  49.79 
 
 
240 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.86 
 
 
264 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 
242 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>