More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1984 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1984  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7684  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4206  ABC transporter related  66.24 
 
 		 240 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  67.09 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  64.32 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4884  ABC transporter related  65.27 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  65.94 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4058  ABC transporter related  65.4 
 
 		 240 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2553  ABC transporter related  65.64 
 
 		 249 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0329  ABC transporter related  64.02 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 233 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  47.86 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.57 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  48.31 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.38 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  41.38 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.16 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  45.3 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.67 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  40.77 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  42.49 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  40.09 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  41.7 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  41.7 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.24 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  41.67 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  40.51 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  41 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  41 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  41.78 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.25 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  40.51 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.31 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  41.84 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  39.48 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7077  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  40.85 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 240 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  42.49 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  42.02 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2528  ABC transporter related  42.25 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.06 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  41.45 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  36.96 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  42.4 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.86 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  40.51 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.45 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  40.85 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  38.89 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3728  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0255597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  42.55 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  40.52 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  40.76 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  43.36 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  41.28 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  39.41 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>