More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2063 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  80.59 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2553  ABC transporter related  81.3 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0329  ABC transporter related  77.73 
 
 		 243 aa  341  8e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1984  ABC transporter related  66.67 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4884  ABC transporter related  66.24 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  66.67 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7684  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 240 aa  314  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4206  ABC transporter related  64.14 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4058  ABC transporter related  63.29 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  44.73 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  47.46 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.26 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.99 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  45.73 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.77 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  41.95 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.67 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  45.73 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  41.6 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  43.88 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  42.02 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.39 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  43.46 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  43.98 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.8 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  43.46 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.19 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.37 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.37 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.7 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  42.02 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  42.56 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  42.02 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  42.02 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.48 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  40.59 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  43.57 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  43.93 
 
 		 259 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  39.15 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  42.15 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.35 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  40.34 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  41.49 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.08 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  40.72 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  43.16 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  39.92 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  41.6 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  38.46 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  41.84 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.33 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  42.37 
 
 		 251 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  44.17 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.32 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  40.91 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 252 aa  177  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  39.75 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  41.59 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  41.45 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  41.74 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  42.13 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  42.44 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  46.41 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  42.79 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  41 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>