More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3676 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  55.65 
 
 
234 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  51.74 
 
 
232 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  47.83 
 
 
237 aa  226  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.7 
 
 
233 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.28 
 
 
232 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.26 
 
 
233 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  49.1 
 
 
236 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  49.55 
 
 
236 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.86 
 
 
234 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  48.93 
 
 
238 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  50.23 
 
 
248 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  52.15 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 
231 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.86 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.52 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.52 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  49.08 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
238 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  47.21 
 
 
240 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 
234 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  50.24 
 
 
248 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.29 
 
 
237 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  50.71 
 
 
237 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  49.53 
 
 
484 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 
239 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  47.83 
 
 
230 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  45.65 
 
 
254 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  47.39 
 
 
233 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  47.84 
 
 
237 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  46.98 
 
 
251 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.69 
 
 
237 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
238 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.91 
 
 
233 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  46.96 
 
 
233 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  45.69 
 
 
251 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  45.92 
 
 
240 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
234 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.22 
 
 
251 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.78 
 
 
234 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  45.26 
 
 
251 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.1 
 
 
231 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  46.35 
 
 
240 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.91 
 
 
233 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  48.7 
 
 
230 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 
236 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.55 
 
 
237 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.55 
 
 
237 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  43.7 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  47.41 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  48.86 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  48.82 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  48.92 
 
 
236 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  45.45 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  47.85 
 
 
232 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  43.16 
 
 
234 aa  198  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  45.78 
 
 
233 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.22 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  47.39 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.35 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  45.61 
 
 
243 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  47.21 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  43.59 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  42.74 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  45.06 
 
 
233 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  45.73 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  49.37 
 
 
840 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.83 
 
 
238 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  43.4 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  47.21 
 
 
239 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  45.58 
 
 
238 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  46.78 
 
 
240 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  44.77 
 
 
247 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  43.78 
 
 
243 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  43.64 
 
 
242 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.83 
 
 
237 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.37 
 
 
238 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.52 
 
 
258 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  42.74 
 
 
259 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.67 
 
 
237 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  42.06 
 
 
236 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  43.46 
 
 
247 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  46.35 
 
 
236 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  47.42 
 
 
234 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>