More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2562 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  96.57 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  81.9 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  81.47 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  81.47 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  79.65 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  79.65 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  78.35 
 
 		 237 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  77.59 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  76.19 
 
 		 234 aa  363  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  74.03 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  75.76 
 
 		 236 aa  342  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  67.54 
 
 		 237 aa  325  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  65.79 
 
 		 234 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  60.7 
 
 		 231 aa  294  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  60.7 
 
 		 231 aa  294  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  62.28 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.41 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.84 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.16 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  50.22 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  224  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  51.46 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  47.84 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  51.3 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  49.57 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  51.06 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  47.62 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  48.7 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  48.93 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  48.71 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  50.22 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.78 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.26 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.44 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  48.7 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  51.67 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.26 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  48.07 
 
 		 232 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.83 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.7 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.29 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  46.81 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  46.98 
 
 		 243 aa  212  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  46.64 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.7 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  47.39 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  45.3 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  46.22 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.21 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  46.78 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.38 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  46.35 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.52 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  44.44 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.3 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.96 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.52 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.96 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.03 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>