More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1774 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  70.64 
 
 		 231 aa  347  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  68.94 
 
 		 231 aa  345  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  68.09 
 
 		 235 aa  344  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  68.09 
 
 		 231 aa  339  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  68.94 
 
 		 231 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  67.66 
 
 		 231 aa  338  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  68.94 
 
 		 231 aa  338  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  68.09 
 
 		 237 aa  334  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  66.81 
 
 		 231 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.51 
 
 		 239 aa  330  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  66.38 
 
 		 237 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  70.64 
 
 		 235 aa  327  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  65.53 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  65.11 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  68.51 
 
 		 231 aa  321  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  62.98 
 
 		 231 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.44 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  61.02 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  61.28 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  62.93 
 
 		 243 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  61.28 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.89 
 
 		 237 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  55.23 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  54.04 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.44 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.74 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.68 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.74 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.68 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.26 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  47.9 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.26 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.68 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.15 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.92 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.68 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.92 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.26 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.26 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.88 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.88 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.11 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  46.64 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  44.77 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  45.19 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.56 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.3 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  42.68 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.19 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.86 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.68 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  47.66 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 259 aa  198  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  42.26 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  44.02 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.07 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  43.64 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.49 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.8 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  46.46 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.77 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  45.08 
 
 		 536 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  42.62 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>