More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1841 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  88.31 
 
 		 231 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  82.98 
 
 		 235 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  83.55 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  80.95 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  77.92 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  77.92 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  75.76 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  79.22 
 
 		 231 aa  355  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.66 
 
 		 236 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  69.53 
 
 		 239 aa  337  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  69.96 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  68.24 
 
 		 237 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  67.38 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  67.52 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  65.96 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  62.77 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  61.9 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  63.2 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  61.04 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  63.27 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  56.65 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  54.08 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.79 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.09 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.41 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  50.7 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  50.7 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.78 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.78 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  48.26 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  47.41 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  48.48 
 
 		 234 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.59 
 
 		 237 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.69 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.74 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.09 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.59 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.69 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.69 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  46.26 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.24 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  47.14 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  47.14 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  48.05 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  46.48 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  47.91 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  46.45 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.28 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  42.92 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  44.49 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  40.95 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.38 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  43.16 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.59 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.64 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  42.37 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  46.58 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.22 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  43.28 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.1 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.75 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.95 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  43.29 
 
 		 838 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>