More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1979 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  88.56 
 
 		 236 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  62.55 
 
 		 237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.13 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  63.45 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  60.34 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  59.91 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  60.83 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  60.09 
 
 		 237 aa  284  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  58.19 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  60.83 
 
 		 536 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  60.5 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  60.08 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  48.5 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  57.33 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.07 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  51.93 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  51.07 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  51.07 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 238 aa  227  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  51.07 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  47.44 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  47.66 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  47.44 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  47.44 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.9 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  47.23 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.46 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  46.81 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  45.49 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  47.23 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  45.8 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.97 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.86 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.68 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.06 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  46.15 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  48.29 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.88 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  47.64 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.52 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.3 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  46.35 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.76 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  46.58 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.76 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  47.64 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.26 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  47.68 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.34 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  47.62 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  39.74 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  47.64 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.06 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  42.74 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  46.19 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.64 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.3 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  42.74 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  48.93 
 
 		 484 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.96 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.07 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  49.33 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  44.68 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  44.07 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 		 238 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>