More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1570 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  96.1 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  95.69 
 
 		 232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  90.48 
 
 		 231 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  69.43 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.81 
 
 		 239 aa  324  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  67.97 
 
 		 241 aa  324  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  66.52 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  65.96 
 
 		 239 aa  321  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  66.09 
 
 		 239 aa  321  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  66.95 
 
 		 237 aa  321  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.44 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  61.04 
 
 		 231 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  61.47 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  60.17 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  60.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  61.04 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  61.04 
 
 		 231 aa  294  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  61.28 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  58.72 
 
 		 235 aa  290  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  62.77 
 
 		 231 aa  287  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  287  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  57.51 
 
 		 238 aa  269  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 238 aa  267  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  52.99 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  52.56 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.43 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.96 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  49.79 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.05 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.05 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.23 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  49.11 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.14 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.9 
 
 		 259 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.9 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.91 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.91 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.91 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 259 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  44.64 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.38 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  45.61 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  50.24 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  44.12 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  48.13 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.98 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  48.83 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.29 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.84 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.29 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.5 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  47.66 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  48.36 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  45.89 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  46.51 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.95 
 
 		 248 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  46.05 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  46.05 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  45.92 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.43 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.19 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  47.98 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  46.19 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  44.14 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  42.42 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.49 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  44.16 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>