More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0157 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  96.91 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  71.02 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  71.01 
 
 		 244 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  73.11 
 
 		 536 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  66.11 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  66.53 
 
 		 237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  64.73 
 
 		 237 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  59.07 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  59.07 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  58.65 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  60.08 
 
 		 236 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  60.5 
 
 		 236 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  48.51 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.74 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.9 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  49.58 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  47.28 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  47.77 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  48.74 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.92 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  48.54 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  49.58 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.33 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.33 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.76 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.08 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.93 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.16 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.5 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  48.82 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.06 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  47.9 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  44.67 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.48 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  49.16 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  44.26 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.69 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  47.9 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.64 
 
 		 233 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  48.12 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.52 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.92 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.67 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.64 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  48.31 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.48 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.64 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.64 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  46.03 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  49.37 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  45.42 
 
 		 238 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.8 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  46.86 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.97 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  46.86 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.77 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  47.48 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  47.74 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  49.18 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  49.18 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  48.33 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  47.06 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  46.64 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.96 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.96 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  46.91 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.06 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  47.06 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  45.64 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.52 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  47.58 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  44.54 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.95 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  45.8 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  44.96 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>