More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1321 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 237 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  93.67 
 
 		 237 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  73.42 
 
 		 237 aa  344  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.6 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  54.04 
 
 		 239 aa  267  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  54.04 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  54.51 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  54.47 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  53.65 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  55.36 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  54.08 
 
 		 231 aa  261  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  54.08 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  54.08 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  53.65 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  53.22 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.89 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  56.65 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  52.79 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  54.04 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  57.81 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  55.7 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  55.7 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  50.43 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  54.85 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  50 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  48.72 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  51.27 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  54.43 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  56.54 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  49.79 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  56.12 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0909  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.7 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0440  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0722  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.452485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1440  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.27 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.56 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  48.29 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  48.92 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.4 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.4 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  48.52 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.04 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.07 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.19 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  43.04 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.19 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.95 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  43.46 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.83 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  43.88 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.07 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.37 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  42.37 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  39.39 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  43.78 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.13 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  42.98 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.55 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  42.98 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  44.54 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.21 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  42.5 
 
 		 259 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.98 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  41.53 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  41.53 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  42.92 
 
 		 259 aa  184  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  43.28 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  43.78 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  43.35 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  42.13 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  42.37 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.18 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.84 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  47.26 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.48 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  42.13 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  43.24 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  44.68 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  42.8 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.33 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>