More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2124 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  65.25 
 
 		 236 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  65.25 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  67.8 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  66.53 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  63.14 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  64.14 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  63.95 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  55.79 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  59.23 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  57.81 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  54.94 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  55.36 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  57.51 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  52.36 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  53.39 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  53.81 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  52.97 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  54.31 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  50.64 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  48.07 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  48.95 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  50.64 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  50.85 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  48.93 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  48.09 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  52.1 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.81 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.25 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  47.44 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.86 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.86 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.73 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  48.72 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.41 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.51 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.06 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  47.01 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.16 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.11 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  51.48 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  48.31 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.84 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44.4 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.83 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.99 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  45.99 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0502  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.7 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0108614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.86 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>