More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1754 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  89.54 
 
 		 239 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  89.54 
 
 		 239 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  80.26 
 
 		 237 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  80.08 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  69.53 
 
 		 231 aa  337  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  69.1 
 
 		 231 aa  334  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  69.53 
 
 		 231 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  68.24 
 
 		 231 aa  332  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  67.66 
 
 		 235 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.51 
 
 		 236 aa  330  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  66.95 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  67.81 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  66.95 
 
 		 232 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  67.81 
 
 		 232 aa  324  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  67.38 
 
 		 231 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  66.95 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  66.95 
 
 		 231 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  65.25 
 
 		 235 aa  309  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  66.52 
 
 		 231 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  64.05 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  64.94 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  58.9 
 
 		 238 aa  281  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  57.87 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  57.02 
 
 		 237 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.6 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.68 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  47.68 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.74 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  48.5 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.35 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  48.09 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.9 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  48.57 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.76 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.21 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  52.09 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.26 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  51.13 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.99 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  47.01 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.44 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  48.17 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.01 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.01 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.24 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  48.1 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  44.3 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  49.36 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.3 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  45.96 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.97 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.97 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.3 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.79 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0909  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.94 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1440  ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0440  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0722  ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.452485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.81 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  45.38 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  48.21 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  45.13 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.8 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.67 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  46.49 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  44.96 
 
 		 536 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.58 
 
 		 251 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.32 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  43.4 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  44.17 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  44.44 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  44.77 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  44.17 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  44.17 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>