More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0860 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  100 
 
 		 536 aa  1073    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  73.41 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  81.25 
 
 		 244 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  76.89 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  79.5 
 
 		 252 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  73.11 
 
 		 259 aa  346  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  65.79 
 
 		 269 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  72.69 
 
 		 259 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.66 
 
 		 269 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  69.58 
 
 		 237 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  70.42 
 
 		 237 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  65.48 
 
 		 265 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.07 
 
 		 823 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  39.93 
 
 		 852 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  41.2 
 
 		 823 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  41.43 
 
 		 827 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  67.65 
 
 		 237 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  38.19 
 
 		 859 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  37.14 
 
 		 838 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  37.82 
 
 		 840 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  38.77 
 
 		 822 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  38.31 
 
 		 842 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  40.16 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  40.31 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  38.28 
 
 		 840 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  39.37 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  64.66 
 
 		 252 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  39.44 
 
 		 502 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 		 263 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  64.75 
 
 		 250 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  37.14 
 
 		 840 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  42.13 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  59.07 
 
 		 234 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  35.27 
 
 		 863 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  58.96 
 
 		 260 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  59.07 
 
 		 234 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  56.96 
 
 		 234 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  56.47 
 
 		 260 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  38.49 
 
 		 490 aa  280  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  59.26 
 
 		 259 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  58.02 
 
 		 260 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.89 
 
 		 832 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  36.91 
 
 		 828 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  60.83 
 
 		 236 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  37.45 
 
 		 549 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  57.98 
 
 		 236 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.87 
 
 		 830 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  34.88 
 
 		 494 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  35.61 
 
 		 873 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  34.86 
 
 		 1302 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  49.35 
 
 		 236 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  52.52 
 
 		 237 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.7 
 
 		 236 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  29.48 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.83 
 
 		 236 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  31.84 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.22 
 
 		 232 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  47.35 
 
 		 254 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  48.32 
 
 		 234 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 230 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.15 
 
 		 248 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  48.32 
 
 		 234 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  48.1 
 
 		 236 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.18 
 
 		 246 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.75 
 
 		 248 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  51.2 
 
 		 259 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  33.72 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  42.8 
 
 		 292 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  48.32 
 
 		 234 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.97 
 
 		 241 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 239 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  46.22 
 
 		 244 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  45.38 
 
 		 251 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  45.38 
 
 		 248 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  46.22 
 
 		 244 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.82 
 
 		 246 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  44.21 
 
 		 249 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  47.16 
 
 		 244 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  47.39 
 
 		 231 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.12 
 
 		 232 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.12 
 
 		 233 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 232 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.18 
 
 		 251 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.85 
 
 		 248 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 		 235 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  46.22 
 
 		 230 aa  203  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.98 
 
 		 246 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  45.82 
 
 		 251 aa  203  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.96 
 
 		 239 aa  203  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 252 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.28 
 
 		 232 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  32.34 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>