More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2954 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  86.89 
 
 		 248 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  85.43 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  85.94 
 
 		 248 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  87.83 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  78.74 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  70.43 
 
 		 244 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  70.43 
 
 		 244 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  66.94 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  66.14 
 
 		 246 aa  349  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  64.38 
 
 		 237 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  66.09 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  62.17 
 
 		 234 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  64.35 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  62.17 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  62.5 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  60 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  60.43 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  63.04 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.2 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  60.43 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60.87 
 
 		 233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  59.74 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  62.61 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  61.44 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  62.61 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  56.43 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  59.02 
 
 		 240 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  62.13 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  59.74 
 
 		 236 aa  297  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  58.9 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.95 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  58.9 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  60.43 
 
 		 233 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 251 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  60.43 
 
 		 233 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  59.74 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  61.7 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  58.47 
 
 		 251 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  58.47 
 
 		 251 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  58.47 
 
 		 251 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.63 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  56.36 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  58.05 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  58.05 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  59.74 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  58.8 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  56.54 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  58.26 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  56.78 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  60.26 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  56.84 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  56.36 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  55.69 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  56.02 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  56.02 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  56.02 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  52.02 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  54.35 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  51.3 
 
 		 230 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  51.3 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  55.5 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.16 
 
 		 231 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  50.48 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  50.48 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  46.09 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.16 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  46.55 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.75 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.75 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.52 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  44.86 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  46.44 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.96 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.56 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.26 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.56 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  47.5 
 
 		 536 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.39 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.39 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.65 
 
 		 234 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>