More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1076 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  89.74 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  88.46 
 
 		 234 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  75.32 
 
 		 237 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  75.97 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  75.21 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  74.89 
 
 		 237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  75.11 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  71.54 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  71.54 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  73.62 
 
 		 237 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  74.89 
 
 		 251 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  74.89 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  74.89 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  74.89 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  74.03 
 
 		 252 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  72.73 
 
 		 247 aa  348  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  71.14 
 
 		 246 aa  348  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.16 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  72.46 
 
 		 236 aa  347  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  71.79 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  73.16 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.03 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  74.03 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  74.03 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  74.03 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  74.03 
 
 		 239 aa  341  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  341  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.59 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  68.38 
 
 		 234 aa  339  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  69.53 
 
 		 239 aa  338  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  69.62 
 
 		 245 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  71.12 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  66.67 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  65.37 
 
 		 240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  64.5 
 
 		 239 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  66.23 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  65.8 
 
 		 243 aa  314  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  61.74 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  62.17 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  64.35 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  61.21 
 
 		 248 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.23 
 
 		 248 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  61.74 
 
 		 233 aa  307  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  62.17 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  63.48 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  63.48 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  60.43 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  61.3 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  62.82 
 
 		 234 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  61.74 
 
 		 233 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  62.61 
 
 		 232 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.61 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60.78 
 
 		 233 aa  302  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  60.87 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  61.3 
 
 		 246 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  60.87 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  59.57 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  57.87 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  57.38 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  56.96 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.52 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  59.43 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50.43 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  46.96 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  46.52 
 
 		 230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  46.52 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.96 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.96 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.41 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.52 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.99 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.46 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.84 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.52 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.52 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  44.83 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.83 
 
 		 232 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.09 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.29 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  48.32 
 
 		 536 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>