More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1755 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  62.93 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  55.65 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  50.86 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  48.71 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  48.71 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  52.73 
 
 		 484 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.62 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.62 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.21 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.55 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.84 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.39 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  49.57 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  51.52 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  46.78 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  47.21 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.05 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.75 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.48 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.75 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  49.14 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  46.12 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  47.19 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.19 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  48.28 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  45.06 
 
 		 244 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.96 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.87 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  46.29 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  47.21 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  46.55 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  45.06 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.46 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  46.29 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  46.96 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  46.09 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.61 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3131  ABC transporter related  48.23 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00980337  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  49.13 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  43.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  43.53 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  51.6 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  46.75 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2763  ABC transporter related  48.23 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.65 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  42.67 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1948  ABC transporter related  48.23 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.68 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  47.83 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45.45 
 
 		 248 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  47.83 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  46.32 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3826  ABC transporter related  46.35 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  48.26 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.22 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  46.32 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.64 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.13 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3714  ABC transporter related  46.9 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  43.7 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.15 
 
 		 256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  43.91 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>