More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1618 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  98.31 
 
 		 246 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  85.65 
 
 		 237 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  86.38 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  78.02 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  66.24 
 
 		 237 aa  324  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  65.82 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  61.6 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  63.71 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  63.52 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  59.32 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  58.9 
 
 		 237 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  58.8 
 
 		 236 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  57.87 
 
 		 236 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  58.08 
 
 		 233 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  55.32 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  56.96 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  54.01 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  55.79 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  48.93 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  52.14 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  48.46 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  51.34 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  48.9 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  48.9 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.06 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.87 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  47.26 
 
 		 237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.04 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.74 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.59 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  48.52 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  44.26 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.64 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  45.81 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  44.12 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  47.44 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  45.53 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  41.77 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  45.99 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  41.35 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.74 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  44.73 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  44.83 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.92 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.19 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  42.73 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  40.77 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.98 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  45.49 
 
 		 739 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  44.64 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  45.19 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  46.58 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.69 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  43.22 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  44.64 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  38.84 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  41.13 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  43.16 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  43.69 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>