More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3272 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  69.53 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  69.96 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  62.5 
 
 		 232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  60.26 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  61.82 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.05 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  59.4 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  59.13 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  60.94 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  56.6 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 236 aa  251  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  56.17 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  59.55 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  58.44 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  58.8 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  58.62 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  56.95 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  57.21 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  55.36 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  55.79 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  55.22 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  53.91 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  51.07 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  53.48 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  53.48 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  56.05 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  53.85 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  51.54 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  51.54 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  52.79 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  50.43 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  51.74 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  57.21 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  51.09 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.37 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  50.43 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.13 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  50.67 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  52.05 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  52.05 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.7 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.29 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  49.34 
 
 		 235 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  48.91 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  48.9 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  49.56 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  49.78 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  50.69 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.05 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.49 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  49.09 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  47.64 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  49.57 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 238 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.7 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  45.89 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.26 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  45.65 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  48.26 
 
 		 739 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.78 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  47.6 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  50.87 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  45.26 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.95 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  48.18 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.19 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  44.49 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  50.87 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  44.93 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.98 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  43.91 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  44.87 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  47.3 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  47.27 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>