More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4778 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  74.57 
 
 		 233 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  74.57 
 
 		 233 aa  345  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  74.57 
 
 		 233 aa  345  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  78.45 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  63.93 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  59.05 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  55.6 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  57.76 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  57.76 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  56.03 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  55.56 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  54.03 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.48 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  49.57 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.09 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  48.26 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.69 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  44.98 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  45.02 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  47.9 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  48.7 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.68 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.26 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  42.06 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  46.32 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.65 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.65 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  46.96 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.65 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  46.96 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  47.93 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.35 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.61 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  50.71 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.61 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.36 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.38 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.36 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  47.96 
 
 		 739 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  46.96 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  45.34 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  49.28 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  45.15 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.92 
 
 		 484 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  45.99 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  42.11 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  42.62 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  41.55 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  46.12 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.86 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  40.17 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  44.86 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  46.95 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  41.56 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  47.14 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  44.4 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  45.15 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.4 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  49.29 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  43.22 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  43.38 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.29 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 256 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  46.48 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.34 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  45.85 
 
 		 859 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  45.54 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  42.49 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  42.61 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.34 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>