More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4221 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  81.86 
 
 		 238 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  81.86 
 
 		 238 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  72.57 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.15 
 
 		 238 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.73 
 
 		 238 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  61.7 
 
 		 237 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  60.43 
 
 		 237 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  52.14 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.3 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  49.13 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  49.79 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  50.23 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  49.57 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  46.86 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  47.83 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  45.85 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  46.96 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.98 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  43.22 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  41.7 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  43.98 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  43.98 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  43.59 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  40.87 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  42.92 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  43.23 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.17 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  40.6 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  42.37 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  42.17 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  42.17 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  43.28 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.38 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  41.74 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  40.95 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.36 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.36 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.99 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  42.06 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.75 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  39.66 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.87 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  44.3 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.97 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 		 238 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.48 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  40.76 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.61 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  40.79 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  40.26 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  41.07 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  41.2 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  40.34 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.31 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  45.54 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.18 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  41.15 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  41.63 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  37.66 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.46 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  40.6 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.13 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.52 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  42.67 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.51 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  40.77 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  42.5 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.31 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>