More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1751 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  85.9 
 
 		 235 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  84.62 
 
 		 234 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  77.14 
 
 		 245 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  74.12 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  62.66 
 
 		 238 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  64.38 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  63.95 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  60.52 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  59.66 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  59.05 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  60.09 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  59.36 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  59.91 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  48.26 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  45.85 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  43.28 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.55 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  47.83 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  45.69 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  45.41 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.35 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  44.3 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  47.39 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.91 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.91 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.06 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.35 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.29 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  46.52 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  43.22 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  43.16 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  44.73 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.4 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  42.06 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.49 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.69 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.99 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  43.48 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  45.69 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  44.3 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.16 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.16 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  39.83 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  49.28 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  45.38 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  43.04 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  42.31 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.75 
 
 		 243 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  41.45 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  44.16 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  43.28 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  41.45 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  42.67 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  42.67 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  42.8 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  45.21 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  44.54 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  42.67 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  44.86 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0669  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.81 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  42.49 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  45.18 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  41.03 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  42.31 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  40.43 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  43.16 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.61 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  40.43 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  41.2 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  38.82 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.13 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>