More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2274 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  83.12 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  63.83 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  63.4 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  60.43 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  61.7 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  50.43 
 
 		 240 aa  228  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.73 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.55 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  48.05 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.59 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.59 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  46.75 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.16 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  46.96 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.78 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  47.47 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  46.09 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.99 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  41.56 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.04 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  44.98 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  45.41 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.56 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  44.98 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  44.19 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.98 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.59 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.54 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.2 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  43.58 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  42.19 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  42.6 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  42.99 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  45.15 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  42.53 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  43.89 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  44.17 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.1 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  41.28 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.24 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  42.6 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.24 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.64 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  43.23 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.68 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  46.12 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  46.12 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.55 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.54 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  44.83 
 
 		 739 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.4 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  40.52 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.4 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  39.74 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  45.21 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  43.83 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.19 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  42.15 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.24 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  42.86 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  45.69 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  45.69 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  41.7 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  45.69 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  41.7 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.24 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.91 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  41.92 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>