More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0697 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  93.1 
 
 		 232 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  92.67 
 
 		 232 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  90.95 
 
 		 232 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  85.78 
 
 		 232 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  84.48 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  84.48 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  84.91 
 
 		 232 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  85.34 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  84.48 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  81.9 
 
 		 232 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  82.33 
 
 		 232 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  81.47 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  79.74 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  80.17 
 
 		 232 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  81.47 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  81.03 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  81.03 
 
 		 252 aa  377  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.95 
 
 		 230 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.4 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  69.4 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  68.1 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.09 
 
 		 230 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.24 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  67.24 
 
 		 230 aa  314  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  66.52 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  66.24 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  62.5 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  68.1 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.1 
 
 		 230 aa  308  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  63.68 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  65.25 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  61.64 
 
 		 230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  63.25 
 
 		 230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  63.36 
 
 		 232 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.07 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  62.07 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.64 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.21 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.21 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  61.21 
 
 		 230 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  61.21 
 
 		 230 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.07 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  62.07 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  61.21 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.21 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  56.65 
 
 		 231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  53.88 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  53.45 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  56.36 
 
 		 236 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  55.56 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.48 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.24 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.61 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.72 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  55.66 
 
 		 231 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  55.96 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.87 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.99 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.54 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  54.72 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.54 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  54.72 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.25 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  53.02 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  49.78 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  50.22 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.43 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.67 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.78 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.85 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  51.29 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.56 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  52.78 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  50.21 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  50 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  48.23 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  49.14 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  52.09 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  51.5 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.45 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.45 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  53.21 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1771  ABC transporter related  43.53 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>