More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4010 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  78.45 
 
 		 233 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  72.53 
 
 		 233 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  72.1 
 
 		 233 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  71.12 
 
 		 233 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  64.86 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  58.62 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  59.91 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  59.91 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  58.19 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  58.19 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  58.02 
 
 		 245 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  58.19 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  56.13 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.43 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.21 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.78 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  49.35 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  49.57 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  48.05 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  48.48 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  46.09 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  49.78 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  45.8 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  46.58 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  44.73 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  49.11 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.29 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.68 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  44.64 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  47.19 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  43.23 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.42 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  49.04 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.16 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.83 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  44.16 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  44.16 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  40.77 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  45.3 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.3 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  47.87 
 
 		 484 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  41.45 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.42 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  44.87 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  45.26 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.23 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  43.13 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  44.89 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  45.89 
 
 		 739 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  46.84 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  44.59 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  45.92 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  46.64 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.59 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.22 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  43.75 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  41.48 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  45.69 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  44.07 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.92 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  43.78 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  44.49 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  44.02 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  45.02 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  44.92 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.98 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  47.6 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  45.5 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>