More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3734 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  94.54 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  94.12 
 
 		 238 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  77.31 
 
 		 238 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  76.47 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  72.57 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  60.43 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  59.15 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  48.1 
 
 		 240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  48.26 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  48.05 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  47.83 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.15 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  48.26 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  49.32 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  48.05 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  48.05 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  48.05 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  44.98 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  48.26 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  45.85 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.74 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  45.83 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  42.4 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.66 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  39.24 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  40.43 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  40.43 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.45 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  40.87 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  40.43 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.22 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  44.84 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  43.46 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.24 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  42.02 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  41.7 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  41.7 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  43.05 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  38.66 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.87 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  42.53 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  40.95 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.18 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  41.1 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.38 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.38 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.95 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  42.37 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  41.03 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  42.47 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.67 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  39.91 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  39.48 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  40.42 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  43.59 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  39.91 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  40.34 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40.59 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.26 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.34 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  39.32 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0314  ABC transporter related  44.91 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  43.04 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  41.81 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.84 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  41.39 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  38.36 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  40.36 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  39.66 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>