More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4021 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  69.78 
 
 		 232 aa  321  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  70.22 
 
 		 232 aa  321  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  69.06 
 
 		 231 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  56.52 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  55.22 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.39 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  54.78 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  54.35 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  54.35 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.27 
 
 		 231 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.78 
 
 		 231 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.82 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  57.27 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.21 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  56.36 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.28 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  53.04 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.04 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.52 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  52.81 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.21 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  55.45 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.77 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.08 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  54.55 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  51.52 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  55.09 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.77 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  52.38 
 
 		 232 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  54.71 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  51.08 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.23 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.23 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  50.45 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  52.23 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.88 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.04 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  49.78 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.34 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  52.04 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  50 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  46.96 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  49.35 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.55 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  46.38 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.18 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  47.27 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.18 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.18 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.18 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.26 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.39 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.95 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  48.58 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.45 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.27 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.96 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  47.73 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  48.62 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  45.41 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.17 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  48.85 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.17 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  48.85 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.22 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.18 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.32 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.87 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.64 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.78 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  47.73 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.18 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  46.09 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  47.73 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  47.73 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  47.11 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.27 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.18 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.42 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>