More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3860 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  93.89 
 
 		 229 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  93.45 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  89.52 
 
 		 229 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  78.95 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  78.17 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  77.29 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  77.29 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  77.29 
 
 		 229 aa  359  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  75.98 
 
 		 252 aa  358  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  66.38 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.07 
 
 		 229 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  62.88 
 
 		 229 aa  307  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1771  ABC transporter related  62.45 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  63.32 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  64.19 
 
 		 229 aa  302  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.76 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.01 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.32 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.32 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  61.57 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  60.7 
 
 		 229 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  60.7 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  60.7 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  58.52 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.52 
 
 		 229 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  58.08 
 
 		 229 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  52.09 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.55 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.89 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.55 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  52.09 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  52.09 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  45.45 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.27 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  45.89 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.28 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  52.09 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.8 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  50.45 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.8 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  51.18 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.18 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.59 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  52.34 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.8 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  51.4 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.59 
 
 		 231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.75 
 
 		 231 aa  221  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.93 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  46.96 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.24 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  44.16 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  49.08 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.83 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.5 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 		 231 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.82 
 
 		 230 aa  217  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  51.13 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  51.13 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.32 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  44.16 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.89 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.13 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.76 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.45 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.24 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  43.72 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.46 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  48.9 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.53 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.29 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  48.68 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.53 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  48.58 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  50.71 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  50.24 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  42.42 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>