More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0956 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  94.35 
 
 		 230 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  80.43 
 
 		 230 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  80.43 
 
 		 230 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  78.7 
 
 		 230 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  77.39 
 
 		 235 aa  360  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  75.22 
 
 		 230 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  77.39 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  77.39 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  77.39 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  76.96 
 
 		 230 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  76.96 
 
 		 230 aa  357  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  75.22 
 
 		 230 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  76.09 
 
 		 230 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  73.04 
 
 		 230 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 230 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 230 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 		 230 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  73.04 
 
 		 230 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  71.3 
 
 		 230 aa  344  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 230 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  74.35 
 
 		 230 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 230 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 		 230 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.24 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  65.38 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  66.38 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  65.95 
 
 		 232 aa  314  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  64.22 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.96 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  64.35 
 
 		 230 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  64.96 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  64.66 
 
 		 232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  64.78 
 
 		 230 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  63.64 
 
 		 231 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.91 
 
 		 230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.64 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  63.25 
 
 		 232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  63.04 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  64.35 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.82 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  62.82 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  62.07 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.25 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.3 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.64 
 
 		 252 aa  298  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  61.97 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  62.39 
 
 		 234 aa  294  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.11 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  61.21 
 
 		 232 aa  290  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.3 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  55.84 
 
 		 231 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.47 
 
 		 231 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  55.93 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  56.28 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  56.07 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  53.22 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  56.11 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  55.41 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  55.6 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.77 
 
 		 231 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.55 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.99 
 
 		 250 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.81 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.81 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.14 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.55 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  51.93 
 
 		 250 aa  238  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  55.2 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  55.66 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.3 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  54.98 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  50.87 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  55.2 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.5 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.68 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  51.95 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  48.09 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1316  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000226028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  51.71 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1044  ATPase  50 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  50 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2246  ATPase  51.71 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08841  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  49.15 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0825  ATPase  50 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  50.65 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  47.19 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08821  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  48.72 
 
 		 236 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.532536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  46.09 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  46.96 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.39 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  46.96 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>