More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0990 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  94.35 
 
 
230 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  82.17 
 
 
230 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  82.17 
 
 
230 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  80.87 
 
 
230 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  77.83 
 
 
235 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  77.83 
 
 
230 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  77.83 
 
 
230 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  77.83 
 
 
230 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  76.09 
 
 
230 aa  361  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  77.39 
 
 
230 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  77.39 
 
 
230 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  76.09 
 
 
230 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  75.65 
 
 
230 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  72.17 
 
 
230 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  73.91 
 
 
230 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.22 
 
 
230 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.22 
 
 
230 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.22 
 
 
230 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  74.78 
 
 
230 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 
230 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 
230 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.78 
 
 
230 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  73.04 
 
 
230 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  65.38 
 
 
232 aa  317  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  64.96 
 
 
232 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  65.95 
 
 
232 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.96 
 
 
230 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.36 
 
 
232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  64.22 
 
 
232 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  65.81 
 
 
232 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  64.78 
 
 
230 aa  308  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  65.38 
 
 
232 aa  307  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  62.61 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.04 
 
 
230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  63.68 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.64 
 
 
232 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  62.34 
 
 
231 aa  300  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.74 
 
 
230 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  63.91 
 
 
230 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.21 
 
 
232 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  62.17 
 
 
232 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.82 
 
 
232 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  62.82 
 
 
232 aa  297  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.25 
 
 
232 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.64 
 
 
252 aa  296  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  63.25 
 
 
234 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  62.39 
 
 
232 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  59.91 
 
 
232 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  61.64 
 
 
232 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 
232 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.87 
 
 
230 aa  289  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.54 
 
 
232 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  54.98 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  54.35 
 
 
229 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  58.6 
 
 
231 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  56.36 
 
 
236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  56.28 
 
 
231 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  53.65 
 
 
232 aa  254  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  54.11 
 
 
231 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  54.74 
 
 
232 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  54.11 
 
 
231 aa  247  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.55 
 
 
231 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
234 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.85 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.11 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.38 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.38 
 
 
231 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.28 
 
 
233 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.25 
 
 
231 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.25 
 
 
231 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  51.93 
 
 
250 aa  238  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  50.87 
 
 
229 aa  237  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  54.98 
 
 
229 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  51.08 
 
 
231 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1316  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 
236 aa  234  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000226028  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.55 
 
 
229 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  48.51 
 
 
235 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  54.05 
 
 
231 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  53.39 
 
 
231 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
237 aa  231  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.49 
 
 
231 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 
231 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  52.94 
 
 
231 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  52.14 
 
 
255 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  48.92 
 
 
231 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2246  ATPase  51.28 
 
 
236 aa  222  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.03 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1044  ATPase  50 
 
 
235 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  50 
 
 
235 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  46.52 
 
 
229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  50.65 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2616  ATPase  49.58 
 
 
251 aa  218  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0328199  normal  0.247142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  50.22 
 
 
232 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 
232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1429  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.11 
 
 
236 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2927  ABC transporter related  45.11 
 
 
236 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.676713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 
248 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  47.39 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08841  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  48.29 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>