More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4008 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  87.83 
 
 		 230 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  88.31 
 
 		 231 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  86.52 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  80.34 
 
 		 234 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  81.3 
 
 		 230 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  80.87 
 
 		 230 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.96 
 
 		 230 aa  360  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  72.61 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.97 
 
 		 232 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.53 
 
 		 232 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  69.13 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.1 
 
 		 232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.1 
 
 		 232 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  68.53 
 
 		 232 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  67.24 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  66.81 
 
 		 232 aa  314  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  66.81 
 
 		 232 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  66.81 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.81 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  66.38 
 
 		 232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.67 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  66.81 
 
 		 232 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.81 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.38 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  66.38 
 
 		 232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  65.95 
 
 		 232 aa  307  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.04 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.38 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  63.91 
 
 		 230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  63.48 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  63.04 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  63.36 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.04 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.91 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.91 
 
 		 230 aa  300  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.74 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  61.74 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.48 
 
 		 230 aa  294  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.74 
 
 		 235 aa  294  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  60.87 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.04 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  60.87 
 
 		 230 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  60.87 
 
 		 230 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  60 
 
 		 230 aa  287  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  59.57 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  60.43 
 
 		 230 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  59.74 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  61.86 
 
 		 231 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  57.14 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  55.84 
 
 		 231 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  63.98 
 
 		 231 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.28 
 
 		 231 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  64.45 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.56 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  53.68 
 
 		 231 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  63.03 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  62.09 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  56.28 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  52.81 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.67 
 
 		 231 aa  251  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  54.55 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.38 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  52.38 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  57.48 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  53.04 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.28 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  56.33 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.33 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.71 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.08 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  53.08 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  52.73 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  48.51 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  49.79 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  53.25 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  49.57 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.09 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  53.7 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.09 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.81 
 
 		 250 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.24 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  50.64 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  49.76 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  49.78 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.46 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.96 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.82 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.09 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  48.82 
 
 		 229 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  46.52 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>