More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3935 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  80.87 
 
 
230 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.13 
 
 
230 aa  325  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  69.57 
 
 
230 aa  321  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  69.13 
 
 
230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  69.26 
 
 
231 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  68.7 
 
 
232 aa  317  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.39 
 
 
230 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.09 
 
 
230 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.09 
 
 
230 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  66.96 
 
 
230 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  70.93 
 
 
232 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  66.52 
 
 
230 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  71.37 
 
 
232 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  66.96 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  69.6 
 
 
232 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  70.48 
 
 
232 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  70.04 
 
 
232 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  67.39 
 
 
230 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  68.1 
 
 
232 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  68.1 
 
 
232 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.81 
 
 
232 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  67.67 
 
 
232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  66.38 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  66.81 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  66.38 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  65.09 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.72 
 
 
232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  65.22 
 
 
230 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  66.52 
 
 
230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  64.66 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.72 
 
 
232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.22 
 
 
232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.78 
 
 
230 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.91 
 
 
230 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.35 
 
 
235 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  63.91 
 
 
230 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
252 aa  299  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  65.38 
 
 
234 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  64.35 
 
 
230 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  64.35 
 
 
230 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.91 
 
 
230 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  62.17 
 
 
230 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.48 
 
 
230 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 
230 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 
230 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 
230 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  63.48 
 
 
230 aa  294  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.61 
 
 
230 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 
230 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 
230 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 
230 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  58.19 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  58.01 
 
 
231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  55.84 
 
 
231 aa  258  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.58 
 
 
231 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  56.71 
 
 
231 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.14 
 
 
231 aa  254  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.28 
 
 
231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.98 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  56.47 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  55.84 
 
 
231 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  54.27 
 
 
233 aa  251  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
234 aa  251  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  57.14 
 
 
231 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  55.41 
 
 
231 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  58.82 
 
 
231 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  55.84 
 
 
231 aa  248  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  55.22 
 
 
229 aa  248  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  54.55 
 
 
231 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  55.56 
 
 
250 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  54.66 
 
 
236 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.92 
 
 
231 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.04 
 
 
229 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  58.37 
 
 
231 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  54.51 
 
 
232 aa  244  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  57.73 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  55.17 
 
 
232 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  52.61 
 
 
229 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  51.5 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  53.04 
 
 
235 aa  234  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  52.81 
 
 
231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.38 
 
 
232 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  52.38 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  48.94 
 
 
235 aa  231  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
237 aa  231  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
231 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  53.19 
 
 
255 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  51.3 
 
 
229 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  48.7 
 
 
229 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  46.75 
 
 
231 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
231 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.24 
 
 
257 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.7 
 
 
248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
229 aa  221  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.39 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.7 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.57 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.57 
 
 
233 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  48.26 
 
 
229 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>