More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3236 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  100 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  64.07 
 
 
231 aa  299  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  55.84 
 
 
251 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  49.35 
 
 
234 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  50.65 
 
 
231 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
231 aa  234  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3802  ABC transporter related  52.38 
 
 
230 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 
231 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2592  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 
230 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.43 
 
 
233 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  49.35 
 
 
231 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  45.89 
 
 
231 aa  228  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  48.05 
 
 
231 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 
231 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  48.92 
 
 
231 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  50.86 
 
 
229 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  48.92 
 
 
231 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.78 
 
 
231 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  49.78 
 
 
231 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2326  ABC transporter related  50.22 
 
 
230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.0685301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2287  ABC transporter related  50.22 
 
 
230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2334  ABC transporter related  50.22 
 
 
230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
237 aa  221  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.92 
 
 
231 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  49.78 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.48 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  48.93 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.22 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.22 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  48.07 
 
 
232 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.62 
 
 
231 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.48 
 
 
230 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 
231 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
230 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  47.41 
 
 
232 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  48.92 
 
 
231 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  46.75 
 
 
229 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  47.19 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  47.62 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.62 
 
 
252 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  47.84 
 
 
232 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.48 
 
 
230 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.29 
 
 
250 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  46.81 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.62 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.05 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  45.69 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.48 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
229 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  49.79 
 
 
235 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1044  ATPase  49.79 
 
 
235 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 
250 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 
232 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.19 
 
 
230 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
230 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 
248 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.83 
 
 
232 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 
229 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.4 
 
 
232 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.83 
 
 
232 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  52.36 
 
 
232 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.59 
 
 
237 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 
232 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  48.28 
 
 
230 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.28 
 
 
230 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 
232 aa  207  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  45.22 
 
 
235 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 
233 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
229 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 
230 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 
229 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  47.19 
 
 
230 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  48.2 
 
 
233 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.89 
 
 
229 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  45.45 
 
 
232 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.45 
 
 
229 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  46.55 
 
 
230 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 
232 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.62 
 
 
230 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.29 
 
 
229 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  45.89 
 
 
230 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  45.89 
 
 
229 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  45.89 
 
 
230 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  45.89 
 
 
229 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.32 
 
 
230 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  44.16 
 
 
229 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.16 
 
 
232 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.89 
 
 
233 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
232 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  45.69 
 
 
232 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  48.29 
 
 
255 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
235 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 
252 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 
232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  44.16 
 
 
229 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  45.69 
 
 
232 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  47.19 
 
 
230 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>