More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2287 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2326  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.0685301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2287  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2334  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3802  ABC transporter related  92.61 
 
 
230 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2592  ABC transporter-related protein  92.17 
 
 
230 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  68.4 
 
 
230 aa  304  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.35 
 
 
251 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.02 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.22 
 
 
231 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  45.45 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  45.02 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
231 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.67 
 
 
229 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.78 
 
 
230 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.48 
 
 
230 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  46.35 
 
 
232 aa  194  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.29 
 
 
231 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.61 
 
 
230 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  45.92 
 
 
232 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44.16 
 
 
231 aa  191  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.06 
 
 
232 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
232 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 
232 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 
232 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  44.21 
 
 
232 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  45.92 
 
 
232 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
230 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.43 
 
 
229 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
232 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.61 
 
 
230 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0997  ABC transporter related  43.29 
 
 
231 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 
232 aa  187  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
234 aa  187  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  42.86 
 
 
231 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.87 
 
 
233 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.09 
 
 
229 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.61 
 
 
230 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
252 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  45.49 
 
 
232 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  43.29 
 
 
232 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.21 
 
 
232 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  41.56 
 
 
231 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
232 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  41.99 
 
 
231 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.21 
 
 
232 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
230 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.48 
 
 
230 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
230 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.17 
 
 
230 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
230 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.42 
 
 
231 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.17 
 
 
230 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  38.7 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.38 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.74 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  41.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  41.38 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  41.38 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  40.69 
 
 
229 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.13 
 
 
231 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.61 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  40.95 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  42.42 
 
 
231 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.77 
 
 
233 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  41.74 
 
 
232 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.17 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  42.17 
 
 
230 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.42 
 
 
231 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  39.22 
 
 
232 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  41.74 
 
 
229 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
231 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.41 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  42.17 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  42.17 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.81 
 
 
229 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.41 
 
 
248 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.35 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  42.92 
 
 
232 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
229 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.41 
 
 
250 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 
230 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.16 
 
 
257 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  40.77 
 
 
250 aa  177  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  39.57 
 
 
235 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.74 
 
 
233 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  39.57 
 
 
230 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  40.87 
 
 
230 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.74 
 
 
230 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
235 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.49 
 
 
254 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>