More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0314 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0314  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120322  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  48.07 
 
 
234 aa  218  5e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  49.58 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 
249 aa  210  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  47.01 
 
 
234 aa  210  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  45.19 
 
 
240 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  46.96 
 
 
277 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.67 
 
 
244 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  50.23 
 
 
234 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  47.26 
 
 
251 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  43.93 
 
 
240 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  45.8 
 
 
235 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  44.26 
 
 
244 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  42.08 
 
 
242 aa  208  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  45.64 
 
 
243 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44.49 
 
 
236 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
234 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.7 
 
 
236 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
247 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  47.01 
 
 
234 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
245 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  46.44 
 
 
247 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  46.81 
 
 
242 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  44.77 
 
 
258 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.99 
 
 
235 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  45.99 
 
 
234 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.44 
 
 
239 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
256 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  45.96 
 
 
258 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  46.03 
 
 
234 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  43.93 
 
 
235 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.15 
 
 
237 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  45 
 
 
240 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  47.93 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  43.59 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  46.94 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  45.3 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.57 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  45 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.04 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  46.44 
 
 
241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
271 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  44.3 
 
 
244 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 
247 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  47.47 
 
 
247 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  43.88 
 
 
234 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  47.47 
 
 
247 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  46.41 
 
 
234 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  42.8 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.04 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.88 
 
 
235 aa  198  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  43.8 
 
 
247 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  45.27 
 
 
291 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  45.15 
 
 
233 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  44.63 
 
 
240 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  46.52 
 
 
238 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  45.08 
 
 
271 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 
238 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
235 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  46.56 
 
 
248 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  45.49 
 
 
274 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.21 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  45.34 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.44 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.88 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.46 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  43.51 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  45.61 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  41.88 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  43.83 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  47.7 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  47.74 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  45.53 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  43.88 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  44.86 
 
 
234 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  44.21 
 
 
247 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.62 
 
 
236 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  45.12 
 
 
269 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  46.19 
 
 
238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.01 
 
 
259 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  49.06 
 
 
237 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.04 
 
 
234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  44.92 
 
 
234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.95 
 
 
233 aa  194  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.26 
 
 
236 aa  194  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
237 aa  194  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
242 aa  194  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>