More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2726 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  86.32 
 
 		 234 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  85.9 
 
 		 234 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  81.63 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  73.73 
 
 		 255 aa  340  8e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 238 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  61.8 
 
 		 238 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  63.4 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  62.98 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  59.46 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  61.54 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  57.76 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  60.68 
 
 		 233 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  60.68 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  58.19 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  47.88 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.86 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  47.83 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  48.47 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  45.38 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  45.85 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.41 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  47.21 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  47.16 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  47.03 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.61 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.48 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.69 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  43.88 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  45.8 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  46.98 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.3 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  44.98 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  44.12 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.64 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  45.41 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  44.21 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  46.09 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  44.1 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  43.16 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  45.15 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  44.73 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  43.16 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  44.07 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  43.53 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  43.35 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  45.02 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.67 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.76 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  42.92 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  43.16 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  44.21 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  44.96 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  42.31 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  40.08 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  43.35 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  45.54 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  43.04 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  43.7 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.7 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  40.95 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  41.45 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  41.28 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>