More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3649 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  87.71 
 
 		 239 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  82.28 
 
 		 237 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  66.95 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  70.45 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  60.59 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  67.29 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  59.66 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  58.05 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  58.05 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  58.9 
 
 		 237 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  57.2 
 
 		 237 aa  284  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  62.88 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  59.91 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  57.45 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  56.64 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  55.51 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  52.23 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  50.22 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  52.25 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  49.3 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  49.16 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  50.69 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  49.17 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  47.6 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  48.07 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  45.58 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  45.18 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.05 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  42.62 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.67 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.49 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  42.36 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  43.42 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  40.91 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 		 484 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.76 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.76 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.76 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  44.96 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.93 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.93 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  44.96 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  43.86 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41.99 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  42.55 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41.99 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.32 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  44.89 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  47.22 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  44.75 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  40.68 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.4 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  45.28 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  46.19 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  42.48 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  42.44 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  43.97 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  41.28 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  43.24 
 
 		 233 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  42.92 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  45.92 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  42.02 
 
 		 259 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  43.04 
 
 		 536 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  45.15 
 
 		 823 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  49.28 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  43.93 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  41.78 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  42.49 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  39.83 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  40.93 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>