More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0652 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  98.74 
 
 		 238 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  94.54 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  76.47 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  75.21 
 
 		 238 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  72.15 
 
 		 241 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  60.43 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  59.15 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  48.47 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  48.03 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  47.62 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.15 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  48.92 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  44.98 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  48.48 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  49.13 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  47.62 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  49.3 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  45.85 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  42.17 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  42.17 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  41.35 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  41.28 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  41.74 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  40.09 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  45.42 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  42.13 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  42.13 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  40.34 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  42.53 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  41.03 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  41.3 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  42.02 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.84 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.84 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  43.38 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.24 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.53 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  38.66 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  39.91 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  44.84 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  40.6 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.95 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0840  ABC transporter related  43.29 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.206601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.62 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.87 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.83 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40.59 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.61 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  40.42 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.34 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  40.95 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0314  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  39.15 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  44.02 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  43.04 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  41.13 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  42.19 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  39.91 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  42.47 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  41.48 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  40.26 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  40.42 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  38.36 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.17 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  38.89 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  39.48 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  42.68 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  38.82 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  39.08 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>