More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0163 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  75.68 
 
 		 245 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  76.08 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  73.73 
 
 		 235 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  74.12 
 
 		 234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.5 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  55.91 
 
 		 238 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  57.09 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  56.3 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  54.17 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  54.03 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  55 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  55 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  56.13 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.62 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  41.9 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  44.31 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  45.02 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  43.48 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.58 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  45 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  42.4 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  42.97 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  46.18 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  43.53 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  43.08 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  45.45 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  44.58 
 
 		 240 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.4 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  44.18 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  40.4 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  39.6 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.7 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  42.23 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.29 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  45.2 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  45.64 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  40.4 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  43.6 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  44.4 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  40.56 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  41.5 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  41.5 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  40.16 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  40.8 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  40.64 
 
 		 231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  41.2 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  40.55 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.6 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  40.64 
 
 		 231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  41.6 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  40.94 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  39.2 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  41.9 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.22 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  43.48 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  42.91 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  40.8 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  40 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  42.69 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  39.36 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  40.8 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  39.92 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  38 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  38.34 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  44.8 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  41.6 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.57 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  40.56 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  38.74 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  39.84 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  41.53 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.82 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  42.08 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  40.8 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  42.69 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.66 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  40.82 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  41.27 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  41.67 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>