More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0083 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  71.67 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  62.88 
 
 		 237 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  61.8 
 
 		 237 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  62.23 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  58.8 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  59.23 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  62.11 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  62.88 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  58.95 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  66.99 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  59.83 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  58.08 
 
 		 237 aa  276  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  58.8 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  54.08 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  56.95 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  52.36 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  51.07 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  51.93 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  47.86 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  45.92 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  48.88 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  48.52 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.49 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  45.92 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  44.21 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  48.07 
 
 		 739 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  45.96 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.49 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  46.64 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.64 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.64 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.64 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.49 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  47.44 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  45.15 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.64 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.3 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  46.08 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  44.84 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  47.03 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  45.49 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.46 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  44.73 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.38 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  43.64 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3728  ABC transporter related  39.57 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0255597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.63 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  42.19 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  43.46 
 
 		 694 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  41.2 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  43.24 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  43.28 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  45.25 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.87 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  41.6 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  44.84 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  38.63 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  44.44 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  41.6 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  40.18 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  44.7 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>