More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3212 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  99.59 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  94.72 
 
 		 246 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  85.71 
 
 		 241 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  85.71 
 
 		 241 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  84.9 
 
 		 239 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.74 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  78.28 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  78.86 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  79.84 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  78.28 
 
 		 237 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  79.51 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  77.14 
 
 		 241 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.33 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.51 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  78.37 
 
 		 252 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  79.51 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  79.1 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  79.51 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  79.1 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  79.51 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  76.73 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  77.96 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  75.2 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  77.05 
 
 		 238 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  71.54 
 
 		 234 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  71.07 
 
 		 247 aa  351  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  71.54 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  69.92 
 
 		 234 aa  344  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  66.67 
 
 		 234 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  65.15 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  61.35 
 
 		 239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  63.41 
 
 		 234 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  61.79 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  64.32 
 
 		 240 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  62.66 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.24 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  59.76 
 
 		 234 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  60.08 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  59.26 
 
 		 233 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  59.18 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  58.09 
 
 		 233 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  57.2 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  55.92 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  60.17 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  59.34 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  57.61 
 
 		 251 aa  286  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  59.67 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  59.67 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  56.79 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  57.2 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  59.34 
 
 		 232 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  59.43 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  57.96 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  56.02 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  58.92 
 
 		 232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  57.61 
 
 		 242 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  57.55 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  56.85 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  57.68 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  56.02 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.11 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.64 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.06 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  43.9 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.06 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  43.57 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.81 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.81 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.23 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.98 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  43.57 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.15 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.15 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  45.98 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  42.74 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.66 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.54 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.81 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.81 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.66 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  44.4 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  44.63 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>