More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5861 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  65.55 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  65.55 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  65.69 
 
 
234 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  64.71 
 
 
234 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  64.29 
 
 
234 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 
234 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 
233 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.05 
 
 
235 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.18 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.17 
 
 
237 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.32 
 
 
233 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.9 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.9 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 
234 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
256 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  45.99 
 
 
236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  45.57 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.84 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.12 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.26 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.22 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  49.16 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.7 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0840  ABC transporter related  47.3 
 
 
237 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.206601 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  48.75 
 
 
260 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  47.39 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  44.73 
 
 
242 aa  211  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  46.64 
 
 
236 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.73 
 
 
235 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.44 
 
 
238 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  47.93 
 
 
236 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  47.26 
 
 
231 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.96 
 
 
235 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45 
 
 
238 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
234 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.06 
 
 
239 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.75 
 
 
235 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.95 
 
 
238 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
237 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.68 
 
 
238 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
235 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.7 
 
 
234 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  47.58 
 
 
241 aa  207  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  45.96 
 
 
235 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.58 
 
 
238 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.7 
 
 
231 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  48.74 
 
 
235 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
238 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.67 
 
 
235 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  47.26 
 
 
234 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
235 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.38 
 
 
232 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.51 
 
 
248 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.7 
 
 
231 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  48.12 
 
 
236 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  46.91 
 
 
259 aa  205  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
238 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.17 
 
 
238 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
237 aa  205  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
235 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
234 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  46.84 
 
 
240 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  47.14 
 
 
241 aa  205  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  43.51 
 
 
236 aa  204  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.11 
 
 
259 aa  204  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.61 
 
 
248 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  43.75 
 
 
238 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  47.06 
 
 
234 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.96 
 
 
234 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 
234 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.46 
 
 
234 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  46.22 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 
234 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  44.63 
 
 
238 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 
234 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  46.03 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.17 
 
 
238 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  45.83 
 
 
238 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.8 
 
 
237 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.17 
 
 
238 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
235 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.8 
 
 
232 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
234 aa  202  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  44.96 
 
 
234 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.75 
 
 
238 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  43.75 
 
 
238 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  45 
 
 
238 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  45 
 
 
238 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.75 
 
 
238 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>