More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2560 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  48.51 
 
 
238 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
238 aa  209  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.91 
 
 
237 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  48.02 
 
 
256 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.47 
 
 
237 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.17 
 
 
233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.17 
 
 
233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
259 aa  201  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.61 
 
 
235 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  48.86 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.12 
 
 
236 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.71 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.87 
 
 
233 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  47 
 
 
232 aa  197  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  46.98 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.73 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.34 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.33 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.45 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  45.5 
 
 
234 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.45 
 
 
235 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.29 
 
 
236 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.99 
 
 
237 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
234 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.29 
 
 
236 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.05 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  44.65 
 
 
238 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
234 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.81 
 
 
237 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4997  ABC transporter related  45.91 
 
 
235 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151213  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  43.61 
 
 
236 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0840  ABC transporter related  43.81 
 
 
237 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.206601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.89 
 
 
233 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.3 
 
 
237 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.97 
 
 
231 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  42.34 
 
 
232 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
238 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3728  ABC transporter related  42.86 
 
 
236 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0255597  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  44.81 
 
 
241 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
236 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  48.25 
 
 
244 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  41.89 
 
 
232 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.83 
 
 
239 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  48.39 
 
 
234 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  43.36 
 
 
237 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 
231 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  42.99 
 
 
234 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  41.15 
 
 
231 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
241 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.22 
 
 
234 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  47.21 
 
 
236 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.15 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.3 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.21 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  45.49 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.44 
 
 
231 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  46.82 
 
 
233 aa  188  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  42.99 
 
 
238 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.15 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  43.4 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.19 
 
 
231 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.39 
 
 
249 aa  188  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.19 
 
 
231 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  43.13 
 
 
248 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.55 
 
 
239 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
238 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  44.83 
 
 
260 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  49.32 
 
 
241 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  44.09 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
233 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  44.55 
 
 
240 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  41.7 
 
 
238 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  40.52 
 
 
237 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  42.67 
 
 
237 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
240 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
239 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.02 
 
 
235 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0329  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  45.11 
 
 
233 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  41.7 
 
 
238 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  45.74 
 
 
243 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>