More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2528 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2528  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  60.34 
 
 		 232 aa  297  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 238 aa  228  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  48.46 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  51.32 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.05 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.9 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.46 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.34 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  42.17 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.83 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.83 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.26 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  49.56 
 
 		 240 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.22 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  42.31 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  47.44 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.7 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.4 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  45.69 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  49.35 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.74 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.1 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.52 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.52 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  46.19 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.61 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.54 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  45.49 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  43.88 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  40.77 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  45.06 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.24 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  44.74 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  48.15 
 
 		 251 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  47.56 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  44.49 
 
 		 243 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.85 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  45.85 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.5 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.98 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  46.4 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  50 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  48.61 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  47.27 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.54 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.1 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  48.61 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.31 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  45.25 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  41.38 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  44.1 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.84 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.67 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  42.24 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.1 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  42.61 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.72 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>