More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  59.66 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.66 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4593  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.39 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  51.46 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.06 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.09 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.11 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  48.51 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.23 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  46.81 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  50.64 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.49 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  55.31 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.28 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  50.64 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  45.96 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.72 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.38 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.84 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.38 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  45.83 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  52.28 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  45.53 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  46.81 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.28 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  47.23 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.23 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  47.01 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 234 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  43.4 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  48.94 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  46.41 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.81 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  47.68 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  46.38 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.81 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  50 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  46.81 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  47.23 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.84 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  46.81 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.11 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.83 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  45.11 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  47.23 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  47.46 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  47.9 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  47.39 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 238 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  47.88 
 
 		 240 aa  198  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  45.73 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  48.94 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  45.73 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  45.15 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  49.58 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  46.03 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  44.68 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.81 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.4 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  48.74 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  47.86 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.4 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>