More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1782 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4593  ABC transporter related protein  73.44 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  59.66 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.05 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.05 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.49 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  54.24 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  51.91 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 247 aa  231  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.63 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.66 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  52.52 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  51.49 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  51.25 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  51.49 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.52 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.51 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  50.64 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  52.54 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  50.64 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  52.97 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  52.77 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.94 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.51 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  48.73 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.91 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.06 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.15 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  48.51 
 
 		 437 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.84 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.74 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.32 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  50.42 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  50.42 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  51.06 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  48.31 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.51 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.5 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  50.42 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  49.37 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  48.99 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.5 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  49.37 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  49.37 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  52.97 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.52 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  50.42 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.66 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  47.46 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  47.06 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  48.35 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  51.91 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  50.64 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  50.64 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  51.85 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>