More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6135 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5537  ABC transporter related  57.08 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0407742  hitchhiker  0.00000719061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7436  ABC transporter  56.36 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5243  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4799  ABC transporter related  45.3 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4888  ABC transporter related  44.87 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.61 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7089  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.23 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  43.59 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  43.83 
 
 		 437 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  44.49 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  44.49 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.88 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.16 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2281  ABC transporter related  45.53 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.22 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  41.45 
 
 		 243 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  44.07 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.92 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  40.95 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  44.07 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  43.35 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.63 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  43.78 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  46.26 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  42.61 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.4 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  43.95 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  43.7 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  43.98 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  43.78 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.13 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  43.1 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  42.31 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  44.02 
 
 		 823 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  41.7 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  42.27 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  40.93 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  40.51 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  40.35 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  42.49 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  42.33 
 
 		 248 aa  185  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  41.2 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  42.37 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  43.93 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  44.91 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  41.45 
 
 		 245 aa  184  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  40.52 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  43.16 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.11 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  43.28 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  42.98 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  42.24 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  42.24 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>